簡史
物理所成立於1993年，於1994年8月開始招生，初期只設有碩士班，因辦學績效與研究成果優異，於1999年獲准成立博士班。成立迄今邁入第13年，在所內同仁積極努力之下，本所於研究及教學上均有可觀的成績，並受到國內物理學界之肯定。

目標
物理所設立的目標有二。除了積極致力於基礎物理科學研究品質之提升，以期各個子領域均能達到國際研究之水準。亦積極致力於物理研究生之教育，建立優良師生互動，激發學生潛能，使具備研究能力，以培養下一代優秀之物理科學研究人才。

發展特色

具多元領域與人才
物理所內目前專任教師九人，研究領域目前可分為：凝態物理（5人）、高能物理（2人）、原子分子物理（1人）及生物物理（1人）四大領域。

具特色發展之實驗室及專精領域
1、凝態物理方面目前有四個實驗室：（A）低溫固態實驗室；（B）奈米表面科學實驗室；（C）有機半導體實驗室；（D）量子體物理實驗室。理論方面有軟凝態物質分子動力模擬電腦室。
2、高能物理包括粒子天文物理及宇宙論，探討極高能量宇宙線之加速機制，能量測量，及相關極高能量微中子之偵測；發展高能量微中子天文學及核子反應器微中子振盪實驗研究。
3、 原子分子物理的研究主要在於發展簡化泛函位能的結構計算方法，並在研究動量空間方法來處理光電子，這兩方面的探討均有助於原子分子物理學的基本研究。另一研究是超冷原子之光物理，包括孤粒子，集體震動，非線性能帶結構，超冷原子的統計力學，非線性方程Adomian解法，光脈波在超冷原子介質的傳遞等。
4、生物物理方面主要是生物馬達的研究，要了解生命體中，奈米尺度機械的運作機制，以及這些生物機制和微小人工機械的相關性。

具嚴謹之課程架構以培養學生具研究能力
在教學方面，課程設計秉持多元化原則。除了一般物理研究所必修之基礎科目，必選科目包括各領域的專業科目，作為學生進入研究之準備。專題研究及論文指導研究目的在使學生學習如何從事研究工作。

積極培養學生具國際化素養及視野
在學生培育方面，我們除了開授課程及論文指導外，也注重拓展學生視野，鼓勵研究生參加國內及國際各項研討會。本所和日本國家理化研究所（RIKEN）簽訂有國際研究生計畫（Joint Graduate School Program），使本所相關領域研究生有機會到RIKEN從事研究。